Работа лаборатории ведётся в соответствии с Федеральным Законом «О племенном животноводстве» и положениями о Племенных книгах животных.
Результаты исследований предоставляются владельцам животных в соответствующие сроки и вносятся в базу данных. Соблюдается установленный порядок хранения, использования и утилизации биообразцов, используемых при исследованиях. Доктором  сельскохозяйственных наук Л.Г. Сурундаевой  лицензирована лаборатория генетической экспертизы (ПЖ77 №009939 приказ МСХ РФ №308 от 05.06.20), которая в дальнейшем получила развитие с созданием Регионального информационно-селекционного центра (ПЖ-77 №011695 приказ МСХ РФ №900 от 30.12.21) и лаборатории селекционного контроля качества молока (ПЖ77 №007368 от 29.12.16). Коллективу центра переданы полномочия на выдачу племенных свидетельств.

Создание Регионального информационно-селекционного центра (ПЖ-77 №007336 от 26.12.16) началось с возрождения лаборатории генетической экспертизы (ПЖ77 №006292 от 19.03.15), история которой началась с лаборатории иммуногенетики.

Лаборатория иммуногенетики образована в институте в 1980 г. (Приказ МСХ СССР № 211 от 11.07.1979 г.). С момента создания и по 1992 год ею руководил кандидат биологических наук В.С. Яковлев. С марта 1992 по февраль 1996 года заведующей лабораторией была Г.И. Кульчумова.
Благодаря их усилиям по организации работы лаборатории, а также сотрудникам отдела за период с 1979 по 1996 год было протестировано около 10000 голов крупного рогатого скота по группам крови и белковым полиморфным системам.
С 1997 года по 2013 год в результате реорганизации лаборатория иммуногенетики входила в состав Комплексной аналитической лаборатории ГНУ ВНИИМС.
С 2010 года руководителем группы генетической экспертизы и книг племенных животных стала кандидат сельскохозяйственных наук, доцент Л.Г. Сурундаева. Деятельность лаборатории иммуногенетической экспертизы осуществляется с октября 2009 г. на основании Федерального закона «О племенном животноводстве» (от 3 августа 1995 г. N 123-ФЗ) и приказа Минсельхоза Российской Федерации № 482. За это время лаборатория дважды прошла лицензирование (свидетельство о регистрации в государственном племенном регистре ПЖ 77 № 008068 от 19 марта 2015 г.) и работает в соответствии с «Правилами генетической экспертизы племенного материала крупного рогатого скота» (одобрены научно-техническим советом МСХ России, протокол № 27 от 29.10.2002 г).
Генотипирование племенного скота проводится по 30 антигенам в 7 системах групп крови. Тестовые сыворотки приобретаются в ОАО «Московское» по племенной работе (Госплемрегистр ПЖ 77 № 006485, приказ МСХ РФ № 270 от 26.06.2015 г.) и ОАО «Самарское» по племенной работе (Госплемрегистр ПЖ 77 № 004510, приказ МСХ РФ № 75 от 13.03.2014 г.) в соответствии со спецификацией.

Лаборатория иммуногенетической экспертизы осуществляет мониторинг племенных животных на основании определения групп крови и семейногенетического анализа в ведущих племрепродукторах по разведению крупного рогатого скота основных молочных пород – симментальской, чернопестрой и красной степной, а также мясных пород – калмыцкой, казахской белоголовой, герефордской, абердин-ангусской и типов – мясной симментал и каргалинский мясной с целью определения устойчивого влияния отбора по продуктивным признакам на степень распространения альтернативных аллелей в генофонде популяций.
За последние годы проведено тестирование более 6000 голов крупного рогатого скота Оренбургской, Челябинской, Курганской, Тверской областей РФ и в Республике Казахстан.
Всего обследовано более 70 стад племенных животных, в том числе 5 племзаводов по разведению крупного рогатого скота молочных и мясных пород.
Протестированное поголовье по частоте встречаемости основных аллелей соответствует породам, по которым ведётся селекционно-племенная работа в хозяйствах. Достоверность происхождения данного поголовья в среднем 96,2 %.

Лаборатория участвовала в проведении исследований по использованию молекулярногенетических маркеров в селекции крупного рогатого скота мясных пород «Использование молекулярно-генетического маркирования признаков при разработке биотехнологии воспроизводства мясного скота» (в рамках федеральной целевой программы «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2012-2013 гг.». Соглашение от 4 октября 2012 г. № 8803).

Совместно с племенными хозяйствами, при участии научных сотрудников института изданы: I (2010 г.) и II (2017 г.) тома «Книги племенных животных герефордской породы», в которых содержатся сведения о 743 гол., I (2012 г.) и II (2017 г.) тома «Книги племенных животных калмыцкой породы» – 1074 гол.; «Книга племенных животных казахской белоголовой породы» – 670 гол. (2011 г.); научное издание «Экспортный потенциал и племенные ресурсы Оренбургской области» (2011 г.)., в которое вошли сведения о 547 высокоценных племенных животных нашего региона.

Лаборатория укомплектована высококвалифицированными кадрами. Сотрудники проходят регулярную переподготовку в лабораториях иммуногенетической экспертизы – ОАО «Московское» по племенной работе, и молекулярно-генетической экспертизы – ФБГНУ «Всероссийский НИИ племенного дела МСХ РФ».
Наличие оборудования лаборатории соответствует «Правилам генетической экспертизы племенного материала крупного рогатого скота» (МСХ России, 2002 г.).
Работа лаборатории ведётся в соответствии с Федеральным Законом «О племенном животноводстве» и положениями о Племенных книгах животных.
Результаты исследований предоставляются владельцам животных в соответствующие сроки и вносятся в базу данных. Соблюдается установленный порядок хранения, использования и утилизации биообразцов, используемых при исследованиях.

• Сурундаева Л.Г. Комплексная оценка биологических особенностей и продуктивных качеств пород и новых типов мясного скота, 2020 г.
• Сурундаева Л.Г. Селекционно-генетическая оценка и методы совершенствования мясного скота шортгорянской породы, 1991 г.